Kvasny Prum. 2013; 59(10-11): 313-316 | DOI: 10.18832/kp2013033

Sekvenace genomu spodní pivovarské kvasinky.Recenzovaný článek

Pavel DOSTÁLEK, Jan KVASNIČKA, Rudolf CEJNAR, Jaroslav VOHANKA, Martin MOKREJŠ, Jaroslava HÁJKOVÁ, Petra BOBČÍKOVÁ, Tomáš BRÁNYIK, Karel MELZOCH, Karel SEDLÁŘ
1 Ústav biotechnologie, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Technická 5, Praha 6, 166 28
2 Trombotické centrum a Centrální hematologické laboratoře, Ústav klinické biochemie a laboratorní diagnostiky, Všeobecná fakultní nemocnice a 1. Lékařská fakulta UK Praha
3 ROCHE s.r.o., Karlovo náměstí 17, Praha 2
4 Ústav biomedicínského inženýrství, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, Vysoké učení technické v Brně, Technická 12, 616 00 Brno

Saccharomyces pastorianus CCY48-91 je kmen pivovarské spodní kvasinky, která je hojně používána v českém pivovarství. Hlavním cílem práce bylo sekvenovat genom této kvasinky a učinit ho dostupným pro širokou vědeckou veřejnost. Data byla zpřístupněna hlavně z důvodu, že neexistuje mnoho průmyslových kmenů kvasinek, jejichž genom by byl znám a byl dostupný.

Klíčová slova: genom, kvasinka, Saccharomyces pastorianus

Vloženo: 15. srpen 2013; Přijato: 1. říjen 2013; Zveřejněno: 1. říjen 2013 

Reference

  1. Bartlett, J. M. S.; Stirling, D., 2003: A Short History of the Polymerase Chain Reaction. PCR Protocols 226: 3-6. Přejít k původnímu zdroji...
  2. Borsting, C., Hummel, R., Schultz, E.R., Rose, T.M., Pedersen, M.B., Knudsen, J., Kristiansen, K., 1997: Saccharomyces carlsbergensis contains two functional genes encoding the acyl-CoA binding protein, one similar to the ACB1 gene from S. cerevisiae and one identical to the ACB1 gene from S. monacensis. Yeast 13: 1409-1421. Přejít k původnímu zdroji...
  3. Casaregola, S., Nguyen, H.-V., Lapathitis, G., Kotyk, A., Gaillardin, C., 2001: Analysis of the constitution of the beer yeast genome by PCR, sequencing and subtelomeric sequence hybridization. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51: 1607-1618. Přejít k původnímu zdroji...
  4. Dunn, B., Sherlock, G., 2008: Reconstruction of the genome origins and evolution of the hybrid lager yeast Saccharomyces pastorianus. Genome Res. 18: 1610-1623. Přejít k původnímu zdroji...
  5. Fernandez-Espinar, M.T., Barrio, E., Querol, A., 2003: Analysis of the genetic variability in the species of the Saccharomyces sensu stricto complex. Yeast 20: 1213-1226. Přejít k původnímu zdroji...
  6. Fujii, T., Yoshimoto, H., Nagasawa, N., Bogaki, T., Tamai, Y., Hamachi, M., 1996: Nucleotide sequences of alcohol acetyltransferase genes from lager brewing yeast, Saccharomyces carlsbergensis. Yeast 12: 593-598. Přejít k původnímu zdroji...
  7. Gonzalez, S.S., Barrio, E., Querol, A., 2008: Molecular characterization of new natural hybrids of Saccharomyces cerevisiae and S. kudriavzevii in brewing. Appl. Environ. Microbiol. 74: 2314-2320. Přejít k původnímu zdroji...
  8. Hansen, J., Cherest, H., Kielland-Brandt, M.C., 1994: Two divergent MET10 genes, one from Saccharomyces cerevisiae and one from Saccharomyces carlsbergensis, encode the α subunit of sulfite reductase and specify potential binding sites for FAD and NADPH. J. Bacteriol. 176: 6050-6058. Přejít k původnímu zdroji...
  9. Hansen, J., Kielland-Brandt, M.C., 1994: Saccharomyces carlsbergensis contains two functional MET2 alleles similar to homologs from S. cerevisiae and S. monacensis. Gene 140: 33-40. Přejít k původnímu zdroji...
  10. Joubert, R., Brignon, P., Lehmann, C., Monribot, C., Gendre, F., Boucherie, H., 2000: Two-dimensional gel analysis of the proteome of lager brewing yeasts. Yeast 16: 511-522. Přejít k původnímu zdroji...
  11. Kleppe, K., Ohtsuka, E., Kleppe, R., Molineux, I., Khorana, H.G., 1971: Studies on polynucleotides. XCVI. Repair replications of short synthetic DNA's as catalyzed by DNA polymerases. J. Mol. Biol. 56(2): 341-361. Přejít k původnímu zdroji...
  12. Kodama, Y., Omura, F., Ashikari, T., 2001: Isolation and characterization of a gene specific to lager brewing yeast that encodes a branched-chain amino acid permease. Appl. Environ. Microbiol. 67: 3455-3462. Přejít k původnímu zdroji...
  13. Martini, A.V., Martini, A., 1987: Three newly delimited species of Saccharomyces sensu stricto. Antonie Van Leeuwenhoek 53: 77-84. Přejít k původnímu zdroji...
  14. Nakao, Y., Kanamori, T., Itoh, T., Kodama, Y., Rainieri, S., Nakamura, N., Shimonaga, T., Hattori, M., Ashikari, T., 2009: Genome sequence of the lager brewing yeast, an interspecies hybrid. DNA Res. 16: 115-129. Přejít k původnímu zdroji...
  15. Querol, A., Bond, U., 2009: The complex and dynamic genomes of industrial yeasts. FEMS Microbiol. Lett. 293: 1-10. Přejít k původnímu zdroji...
  16. Rainieri, S., Kodama, Y., Kaneko, Y., Mikata, K., Nakao, Y., Ashikari, T., 2006: Pure and mixed genetic lines of Saccharomyces bayanus and Saccharomyces pastorianus and their contribution to the lager brewing strain genome. Appl. Environ. Microbiol. 72: 3968-3974. Přejít k původnímu zdroji...
  17. Sanger, F., Coulson, A.R., 1975: A rapid method for determining sequences in DNA by primed synthesis with DNA polymerase. J. Mol. Biol. 94 (3): 441-448. Přejít k původnímu zdroji...
  18. Sanger, F., Nicklen, S., Coulson, A.R., 1977: DNA sequencing with chain-terminating inhibitors. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 74 (12): 5463-5467. Přejít k původnímu zdroji...
  19. Saerens, S.M.G., Duong, C.T., Nevoigt, E., 2010: Genetic improvement of brewer's yeast: current state, perspectives and limits. Appl. Microbiol. Biotechnol. 86: 1195-1212. Přejít k původnímu zdroji...
  20. Shendure, J., Porreca, G.J., Reppas, N.B., Lin, X., McCutcheon, J.P., Rosenbaum, A.M., Wang, D., Zhang Kun, Mitra, R.D., Church, G.M., 2005: Accurate Multiplex Polony Sequencing of an Evolved Bacterial Genome. Science 309 (5741): 1728-1732. Přejít k původnímu zdroji...
  21. Tamai, Y., Momma, T., Yoshimoto, H., Kaneko, Y., 1998: Co-existence of two types of chromosome in the bottom fermenting yeast, Saccharomyces pastorianus. Yeast 14: 923-933. Přejít k původnímu zdroji...
  22. Tamai, Y., Tanaka, K., Umemoto, N., Tomizuka, K., Kaneko, Y., 2000: Diversity of the HO gene encoding an endonuclease for mating-type conversion in the bottom fermenting yeast Saccharomyces pastorianus. Yeast 16: 1335-1343. Přejít k původnímu zdroji...
  23. Wicker, T., Schlagenhauf, E., Graner, A., Close T.J., Keller B., Stein N., 2006: 454 sequencing put to the test using the complex genome of barley, BMC Genomics. 7: 275. Přejít k původnímu zdroji...
  24. Yamagishi, H., Ogata, T., 1999: Chromosomal structures of bottom fermenting yeasts. Syst. Appl. Microbiol. 22: 341-353. Přejít k původnímu zdroji...

Zpět na obsah